《還珠３》儼然就是一部瓊瑤童話的成人版，在流不完的晶瑩淚、訴不完的相思情之上，赫然並列著四大關鍵詞：第三者、私奔、吸毒和仇殺！ 　　小燕子報殺父之仇 　　乾隆３０年，乾隆第４次南巡，大隊人馬中除五阿哥、小燕子、爾康、紫薇等外，還有狂熱而痛苦相恋的晴兒和蕭劍。由於太后干預晴兒的婚事，在對小燕子的哥哥蕭劍進行調查時，發現小燕子與乾隆有著血海深仇。當小燕子得知自己一直敬愛的皇阿瑪竟是殺父仇人時，痛苦萬分，經常頂撞乾隆，甚至不再愛永琪。一日，小燕子受刺激拔劍刺向乾隆，乾隆也拔劍刺向小燕子，這時，永琪用身體擋劍，連中兩劍。小燕子在照顧受傷的永琪時，終於明白生命中最重要的是什麼。 　　尔康另結新欢 　　緬甸攻打邊疆，乾隆派永琪、尔康前往平定。在一次血戰中，尔康身陷重圍，下落不明，３天后，永琪在打掃戰場時發現尔康面目全非的屍體。紫薇得知消息後，精神完全崩潰，陷入麻木，甚至連孩子都不要了。紫薇在幻覺中聽到含香告訴她尔康沒有死，她相信這個幻覺，於是決定到緬甸去尋找爾康。爾康真的沒有死，原來他在戰鬥中被緬甸王的八公主救起，在半夢半醒之際，爾康錯把八公主當成紫薇，八公主故意將錯就錯，結果懷上了爾康的孩子。 　　尔康戒毒癮再回京城 　　紫薇曆盡千辛萬苦找到爾康，卻發現爾康身邊的異族公主和他們的孩子，狂奔著逃出行宮。緬甸王在知道爾康喜歡的是紫薇而不是八公主後，為了阻止尔康回國，不惜用誘騙他吸毒的方式，把尔康推向了一場災難的深淵。後來經過交涉，尔康終於得以返回京城，在永琪、蕭劍等人的幫助下，最終戒除了毒癮，重新回到了紫薇身邊。 　　五阿哥小燕子离开皇宮 　　乾隆得知小燕子身世真相後，命永琪與小燕子斷絕關係，可永琪寧可丟掉王位，也不離開小燕子。乾隆幾經思量，決定讓永琪帶小燕子出宮，成為平民。於是小燕子、永琪離開皇宮，陪伴紫薇走上尋找尔康的漫漫長路。 　　小燕子等人在雲南找不到含香和蒙丹，聽說大理有個蝴蝶泉，猜想含香一定在蝴蝶泉邊住過，不知那美麗的蝴蝶在天上還是在人間，但他們明白只要人間有愛，天上人間都是天堂。在小燕子陪伴下，永琪成了“不凡”的“凡人”，小燕子用她溫暖的心守護著她摯愛的人